L-Inizjattiva tal-Impjegati Speċjalizzati (SEI) hija rotta alternattiva għal ċittadini ta' pajjiżi terzi b'ħiliet għolja, li jistgħu ma jkunux eliġibbli għall-Inizjattiva Tal-Impjegati Ewlenin, iżda li għandhom il-ħiliet akkademiċi, vokazzjonali jew tekniċi rilevanti f'konformità mal-offerta ta' impjieg tagħhom f'Malta. L-applikazzjonijiet tal-SEI jiġu sottomessi skont ir-Regolamenti dwar il-Permess Uniku (L.S. 217.17).

Il-ħin tal-ipproċessar għall-applikazzjonijiet SEI huwa ta' ħmistax-il (15)-il jum tax-xogħol, li jibda mid-data tas-sottomissjoni tal-applikazzjoni. Applikazzjoni titqies sottomessa biss meta tiġi sottomessa d-dokumentazzjoni kollha mitluba, kif deskritta fil-lista ta' kontroll rilevanti.